Việc phân loại hệ Maipure gặp khó khăn vì một số lượng lớn ngôn ngữ đã biến mất hay đang thiếu thông tin. Tuy vậy, ngoài mối quan hệ rõ ràng như giữa các phương ngữ trong một ngôn ngữ, vẫn có những nhánh con thường được chấp nhận. Nhiều phân loại đồng thuận việc chia ngữ hệ này hai nhánh bắc và nam, song không phải ngôn ngữ nào cũng thuộc một trong hai nhánh này. Những nhánh dưới đây được chấp nhận rộng rãi:

• Ta-Maipure = Arawak Caribe / Ta-Arawak = Maipure Caribe,
• Maipure Thượng Amazon = Arawak Bắc Amazon = Maipure Nội địa,
• Maipure Trung = Pareci–Xingu = Paresí–Waurá,
• Piro = Purus,
• Campa = Maipure Tiền Andes.

Trước đây, có sự phân biệt giữa Ta-Arawak và Nu-Arawak, dựa trên tiền tố chỉ ngôi thứ nhất số ít ("tôi"), song sự phân biệt này chẳng có mấy ý nghĩa phân loại: nu- đại diện cho dạng nguyên gốc trong ngôn ngữ Arawak nguyên thuỷ, ta- là một điểm đổi mới chỉ trong một nhánh của ngữ hệ.